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水部（北京城内东单）和第1644部队即华中防疫给水部（南京城内中山路）是两个重要的根据地。1940年6月，在此之前，原在731部队本部的山之内，在晋升少佐的同时，调任华中的第1644部队（第一任队长为增田知贞军医大佐）的‘材料课课长’。这是在该部队工作过的某女抄写员透露的。顺便讲一下。第1644部队的队长，于1941年由太田澄军医大佐接替增田知贞大佐。1942年佐藤俊二军医大佐（和在苏战犯佐藤俊二原军医少将为同一人）又接替了太田大佐。而华北的第1855部队，从1939年末创建以来，一直由西村英二军医大佐担任队长。增田、太田、佐藤和西村四个人被称为‘石井部队四大天王’。他们深受石井宠爱，虽是药剂师的身份，但常和驾驶重型轰炸机的增田美保大佐（新宿区大久保国立资源科学研究所成员浅沼靖氏说）在一起，常在哈尔滨、北京和南京三个点飞来飞去，是进行‘人类大屠杀战’的名人。”
接着，就1938年在平房建立根据地，以后显露731部队本性的过程做了如下的记述：
“1938年底，731部队在满洲国滨江省双城县平房进行大规模工程的招标。”
“石井部队长让宪兵上士乙津一彦对在长春设有分公司的大仓组、清水组、五十岚组、松村组和间组等赶来的大小企业者进行严格的监视。这时，乙津上士派出宪兵对各企业的估价现场进行监视，割断各企业之间的联系。在这种情况下，进行了封闭式的投标。
“‘我记得是松村组中标。石井部队长说搞得不错，表示十分高兴，还给我一笔钱。那个大工程项目，似乎出乎意料的便宜。’（现帝国兴信所第一调查课职员乙津一彦说。）当天晚上，731部队首脑在长春的日本饭馆‘红叶’聚会，举行开工庆祝会。石井部队长还特地遨请宪兵上士乙津出席，并鼓励他说：‘从现在开始要动真格的了。’”
“‘就这样，1939年在平房地区建成了拥有许多研究所和办公室的大规模的军事设施，并把731部队部署在这里。’（起诉状语）”
“731部队只有一个大门，部队的周围全布满了铁丝网。到了晚上通入强电流，闻到人味的狼群常常触及电网，发出令人讨厌的呻吟声。”
“哨兵所由宪兵队和部队各派一名哨兵站岗。带车篷的无窗军用卡车，每周一次从哈尔滨市内的俘虏收容所‘保护院’运来30人。进来以后，没有一个人出去。这些人被叫做‘马鲁太’或‘特殊材料’，关在部队正面的口字型三层建筑的地下室里。最初一周内让他们尽量吃有营养的东西。”
“他们中多半是因间谍嫌疑而被捕的苏联人或中共党员，发给他们的食物无论是什么，他们都默默地吃掉，不久都胖了起来。一周内充分摄取了营养之后，就一个个地被送进实验室。在‘冻伤实验部’开始从手指、脚趾、耳朵、鼻子和睾丸等突出部分进行实验。使用的装置，是一种像冰箱似的玻璃罩，罩内温度可以任意进行调整，最低温度可达零下75度。从外部可以完全看到人体局部在不断冷却中的变化过程，还常常进行摄影。从玻璃罩拉出来的人，被完全固定在床上，然后用手术刀切割冷却的部分，切掉脚、手腕时，还使用钢锯。卫生兵常常在军医的鼓励下拉动钢锯。无论多么坚强的人，这时都会满头大汗，痛苦异常，甚至连拉锯的人，都无法忍受下去。如果拉锯的人停下手来，在一旁进行监视的宪兵就会开枪。上级军医就会责骂道：‘你这家伙，也想得这样下场吗？’但是，这样说的军医本身对于自己将要实施的残虐行为也常常踌躇不前。出现这种情况时，如果石井队长在场，不管是大佐还是少将，都会劈头被叱骂：‘混蛋！别磨磨蹭蹭的！’（以上据原731部队卫生上等兵大泽某谈话）”
关于战时俘虏的处理问题，从石井细菌部队被称为东乡部队时起就一直当宪兵的乙津上士这样说道：
“战争时期，由于对方群情骚然，到处都是土匪、共匪。捉到的人不是每一个人都送到军事会议，而是可以立即加以严惩，再向宪兵本部报告。宪兵内到准尉、上士级就具有这种权限。经我手处理的都是中国人，究竟有多少人，巳记不清楚了。”
京都府立医科大学生理学教授吉村寿人博士，当年是石井四郎部队长选调到731部队冻伤实验部来的技师。听说在俘虏中，听到吉村技师的声音，很少有人不发抖的。
石井四郎的母校是京都大学，在校期间，成绩优秀，当时的校长对他的未来寄予很大的希望，所以让自己的女儿和他结了婚。这段经厉在本书第一集巳作了介绍。石井则从京都大学物色731部队人员，因此，731部队几乎成了“京大派”的天下。
这些情况在《真相》杂志上有如下记载：
“为了补充3000名部队人员，石井部队长飞回国内物色学术界的大人物。他成功地把他在京大时的恩师清野谦次博士（因盗窃国宝而失去京大教授资格的生物学家）和京大的同学、庆应大学病理学教授川上渐博士安排为病理解剖的最高顾问。病理学家、金泽医科大学教授石川大刀雄丸博士积极地参加了部队，使工作干得热火朝天。例如：1940年秋，由于731部队撒布的鼠疫菌，吉林省农安地区流行鼠疫，出现了很多患者，他一个人解剖了57具人体。石川博士本人报告称：‘这在解剖史上创下了世界记录。’（日本病理学学会刊34卷）招来的人中还有被医学界一致公认的北里研究所过滤性病毒权威笠原四郎博士。他在任病毒检验室主任时，表示不愿干这种事，但石井恳求说：‘你虽说不愿干，但是此事非你莫属。’（笠原博士语）笠原博士于1939年参加了731部队。前边已经介绍过的冻伤实验专家、京都府立医科大学的吉村寿人教授、京都大学病理学的冈本耕造教授、兵库县立医科大学细菌学的田部井和教授、长崎医科大学的林一郎教授等关西医学界的权威人士都被石井陆续选调进了731部队。林一郎教授目睹了731部队实验室的惨状之后，立即产生了厌恶情绪，干了不到半年就瞒着石井逃回国内。”
“‘进了731部队，就必须参加石井部队长难以对付的面试。’（国立资源科学研究所所长员浅潘先生语）石井知道林教授逃走后，大发雷霆地说：‘只要抓到他，就立即杀掉！’据说，在战争时期，宪兵一直监视着林教授的行动，简直使他无藏身之地。目前经营《政界吉普》时局杂志的原金泽医科大学细菌学的二木秀夫博士等人，在731部队的技师中可能是属于怪家伙。有柔道四五段之称的二木博士，虽说并不是因为柔道才和‘陆军的放荡公子’（原宪兵上士乙津语）石井四郎将军非常投缘，1938年以来，为了查找‘孙吴热’病原体——731部队的新研究课题，大量屠杀了‘满洲猴’。在满洲供实验用的猴子不管是苏联产的，还是中国产，都叫‘满洲猴’。苏联当局近年来公布细菌战战犯以后，据说，二木博士情绪极度消沉。
“除1945年春在九州被俘的B…29型飞机乘务员8人之外，据说还有40多名仍下落不明的美军俘虏（《朝日新闻》1948年2月26日）。苏联在押战犯唐某、少佐富雄（笔者注：估计可能是原第四部细菌制造课课长柄泽十三夫）说：1943年春天，我在沈阳住院，731部队的科学合作者凑来访时说，他在沈阳正对美军俘虏进行传染病免疫的研究。‘凑专门对俘虏收容所的盎格鲁撒克逊族人一直进行免疫调查’（1949年12月27日哈巴洛夫斯克广播）。陆军军医团杂志（366号）在‘各地研究会记事’栏目中报道说，一个叫‘凑技师’的人写过一个题为‘XX俘虏收容所的印象’的报告。据北里研究所的笠原博士说，凑和凑技师为同一个人，是京都大学医学部的凑正雄讲师。
“石井四郎物色到731部队中来的细菌、病理、生理学方面的学者大部分是他的母校京都大学出身的。继担任731部队华北根据地1855部队最高顾问的宫川米次博士之后，是就任传染病研究所所长的田宫猛男博士（现任山梨医院大学校长）（笔者注：说田宫来自山梨医科大学，是该大学的校长，这并非事实）。他说：‘在军人中能够培养弟子吗？’回绝了石井的劝诱。据说除应召和征用外，东京大学没有一个人参加731部队。石井队长失败以后，又对当时传染病研究所第四研究部部长兼东京大学教授小岛三郎博士进行活动说：‘派你的弟子来吧！’当时，小岛博士正在一个劲地把‘传染研究所’第四研究室培养的细菌送往南京的1644部队。他本来就是约定协助石井合作的，所以答应了。‘我真不愿放他走。在我手下学习的中込君，虽说本人不太愿意，但我打算让这个可爱的孩子出去走走，就给了石井君。’（小岛博士语）据说医学士中込在731部队的细茵实验中由于感染病菌而死亡。”
人才济济的解剖名手
731部队有过为当地的防疫工作做出“贡献”的事实。1940年8月，平房四屯大肆流行霍乱。731部队的凑班秘密进行了调查，查明其发生源是部队的排水。特设监狱和各栋楼的排水和污水消毒不彻底，从动物班（田中班）西侧的污水坑流出，穿过八木泽班西北的小山坡和农场之间的排水沟污染了下流各村庄的饮用水。
由于发生霍乱，四屯处于危急的状态，即使哈尔滨市的报纸也报道说：“本市发生了原因不明的霍乱。”731部队进行了长达40天的防疫活动，霍乱才平息。如果不以“马鲁太”为对象进行细菌实验的话，仅仅是排水不妥当，并不会发生霍乱。这一事实一直保密，几乎所有的队员都不知道。
731部队内设有冈本、石川两个病理班。像“一个人解剖57具人体”的石川班班长等病理解剖的名人，人才济济。
京都大学医学部在校学生，为同学会的前辈们从1929年10月开始每两年不定期地出版一期杂志《芝兰》。1977年11月30日号（79号）刊载了石野琢二郎的一篇文章：
“他于1931年从京大医学部毕业的同时，在病理学教室任助教，在清野谦次教授的指导下专攻病理学。1936年晋升为讲师。1938年作为陆军技师去了满洲，在陆军哈尔滨郊外的研究所研究分析当时尚是未知领域的流行性出血热、森林壁虱脑炎的病因和病理，取得了划时代的成绩。”
“由于我是专攻外科的，所以，当时开始进行肝切除实验性的临床研究。石川君在满洲的研究所工作时，我能够在那个研究所里从事肝切除范围的工作，确认肝的4/5可能切除。他给予我的建议和帮助是很大的。”（石野琢二郎，《芝兰》79号。）
石野在回忆录中谈到的“陆军在哈尔滨郊外的研究所”，就是731部队，“他”即“石川君”就是石川班长。这是很容易推测出来的。
关于石川班长，《真相》同一期中做了如下的记述：
“（前略）解剖‘满洲猴’创下了世界记录的金泽医科大学教授石川太刀雄丸博士、二木秀夫博士以及北里研究所笠原四郎博士等人，由他们率领的各研究班分别被派遣到整个满洲边境地带，采集可能成为病源的老鼠、跳蚤、壁虱、虱子、臭虫和蟑螂等。